一是培养土不合理

羊肚菌发生地的土壤类型有沙质潮土 、壤质潮土 、黏质潮土 、沙质壤土 、褐壤等含腐殖质较多的土壤。种植羊肚菌菌应该制作添加生石灰的偏碱性的营养土 ,营养土的制作过程:木屑(腐熟的牛粪或废菌棒料渣发酵)、麸皮、生石灰、石膏、玉米芯等,这些特质与表层土 一起配合为疏松的营养土,并在营养土中加入蝇蛆速杀等杀虫药物(防治白蚁)、蝼蛄、蛴螬、金针虫、地老虎、蜗牛); 合格的营养土的标准是在浇水后,用手轻握呈团状,用手掌轻拍呈颗粒状,把合格营养土堆积呈15厘米高,宽80厘米的畦埂,畦埂与畦埂与畦埂相隔20厘米,这样有利于浇水和排水,也有利采摘羊肚菌.

二是通风管理不合理

羊肚菌属好氧型真菌,子实体发育阶段需要通气良好.当二氧化碳浓度高时,子实体会出现瘦小,畸形甚至死亡.足够的氧气对羊肚菌的正常生长发育必不可少,因此保持棚内良好的通风条件和土壤通透性至关重要.但要注意通风和温度的协调关系,即要通风, 又要保温,菇蕾幼小时,通风量过大会造成顶尖干死.

三是子实体生长期间没有补充合理的营养

在子实体生长时使用含多种微生物活性酶 、维生素A 、B 、D氨基酸 、核酸 、活性果糖 、葡萄糖等营养物质的营养袋,首先建立有益菌群,促进菌丝健壮,让菌丝体土壤里面的营养转化能力增强,促进羊肚菌生长速度加快,营养袋里面的营养成分被羊肚菌的子实体全面充分吸收,让羊肚菌的菇蕾更多,大小均匀,干物质含量提高,更有韧性,味道更加鲜美.

四是温度和光线管理要加强

温度方面不太好控制,温室 、大棚调节控制温度稍好一些,露天种植羊肚菌对温度调节控制基本为零.光线可以通过遮阴网来调节控制,子实体形成和生长发育需要一定的散射光,七分阴三分阳的光照条件适宜羊肚菌生长.

五是大棚内的空气湿度和土壤湿度不够

这种情况尤其出现在露天种植和太阳能大棚种植羊肚菌的菌农那里,空气湿度一直达不到70-85%的时侯,菇蕾特别容易死亡(尤其在温度持续升高的时候),这时侯应考虑喷淋设备或者是雾化装置进行增湿.土壤方面要随时注意, 一旦湿度降低要随时滴灌或者浇水.
另外,羊肚菌栽培田地不宜连作,如果一块地连续种植,土壤有效成分消耗大,残留物积累多,病虫害会加剧,必将导致羊肚菌出菇较小、较少,甚至不出菇.因此,为避免连作障碍,提倡菌、蔬或菌、粮轮作,可杀死大量有害微生物,同时改变土壤结构和PH值.